Google Colaboratory에 R 커널 설치하기
Stan 커뮤니티의 글을 뒤적거리다가 구글 Colaboratory Notebook에 R 커널을 설치하는 방법을 발견하여 정리한다.
Setup code
Colab에서 R 커널을 설치하기 위한 코드는 다음과 같다.
!apt-get install libssl-dev > /dev/null
!wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
!chmod +x ./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
!./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -p /conda > /dev/null 2>&1
!/conda/bin/conda install -c r r-rstan r-irkernel gxx_linux-64 -y -q > /dev/null 2>&1
!/conda/bin/R -e "IRkernel::installspec(name = 'python2', displayname = 'R', user = FALSE)" > /dev/null 2>&1
!mkdir /root/.R/
!echo "CXX14FLAGS=-O3 -mtune=native -march=native -Wno-ignored-attributes -Wno-deprecated-declarations" > /root/.R/Makevars
import os
os._exit(00)
R 커널 설치 과정
1. Setup Code 실행
- 위 Setup Code 를 한 번 동작시킨다
- 설치하는데 2~3분 정도 소요된다
2. 현재 세션을 종료한다
- 런타임 > 세션관리 > (현재 세션) 종료 를 선택한다
- 영문의 경우 Runtime > Manage Sessions > TERMINATE
3. 런타임을 재시작하고 다시 연결한다
- 런타임 다시 시작 (Restart Runtime) 을 클릭하고, 세션에 “다시 연결”(RECONNECT) 한다
- 설치가 완료되면 python2 커널이 R 커널로 바뀐다
4. R Code를 실행시킨다
- 이제 R Code를 실행시킬 수 있다 (Setup Code는 실행시키지 않는다)
Reset All Runtimes (모든 런타임 재설정) 를 누르면 초기화되어 파이썬 커널로 되돌아간다.
