TIL 포스팅을 작성하기 위해 간만에 맥북 R 환경에 igraph를 설치하려고 했는데 뭔가 문제가 발생했다. 역시 귀찮아서 그냥 서버에서 작업을 할까도 했지만, 그래도 나름 중요한 라이브러리니까 해결하긴 해야겠다 싶어서 정리!
맥에서 igraph 설치하는 과정에서 발생하는 gfortran4.8 에러 해결하기
문제상황
현재 사용하고 있는 맥북은 Sierra 환경이다. igraph를 설치하는 중 다음과 같은 에러가 발생했다
gfortran-4.8 -fPIC -g -O2 -c AMD/Source/amd.f -o AMD/Source/amd.o
make: gfortran-4.8: No such file or directory
make: *** [AMD/Source/amd.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘igraph’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.3/Resources/library/igraph’
Warning in install.packages :
installation of package ‘igraph’ had non-zero exit status
해결방법
간단히 설명하자면 gfortran4.8 설치 후 ~/.R/Makevars 파일을 수정하면 된다. 이전 포스팅 과 연결된 부분이 많으니 참고.
대부분 https://code.i-harness.com/en/q/16ceebb 코드를 바탕으로 해결했다. 우선 gfortran 4.8 버전부터 설치하자.
# gfortran4.8 다운로드
curl -O http://r.research.att.com/libs/gfortran-4.8.2-darwin13.tar.bz2
mkdir /tmp/gfortran
tar fvxz gfortran-4.8.2-darwin13.tar.bz2 -C /tmp/gfortran
# homebrew를 간섭하는 alias 제거
rm /tmp/gfortran/usr/local/bin/gfortran
# gfortran 4.8 설치
cp -r /tmp/gfortran/usr/local/ /usr/local
# ~/.R/Makevars 파일을 만든다 (이미 존재한다면 패쓰)
# mkdir -p ~/.R
# touch ~/.R/Makevars
이전에 발생했던 다른 문제로 인해 Makevars 파일에 사전에 설정해 둔 값이 있다. 따라서 Makevars 파일은 다음과 같이 구성된다.
FLIBS=`gfortran -print-search-dirs | grep '^libraries:' | sed 's|libraries: =||' | sed 's|:| -L|g' | sed 's|^|-L|'`
F77="gfortran-4.8"
FC="gfortran-4.8"
해당 파일 변경 후 igraph 라이브러리가 정상적으로 설치된 것을 확인하였다.
